No Brasil a contabilidade rural é pouco utilizada, seja pelos empresários como pelos contadores, isso porque esse tipo de contabilidade é pouco conhecido, eles ainda desconhecem que as informações obtidas através da contabilidade e de suma importância para uma maior segurança e clareza nos negócios.
A maior dificuldade para a utilização da contabilidade rural é o custo de manutenção do serviço contábil, alem disso há uma grande dificuldade do empresário rural de separar custos de produção com custos de mão de obra, a inexistência de recibos, notas, enfim. Claro que isso não ocorre totalmente, as grandes empresas rurais mantêm esse tipo de controle, já os médios e os pequenos não fazem uso da contabilidade rural.
Sendo assim, os pequenos agricultores e as cooperativas agrícolas, que não fazem uso da contabilidade rural e de nenhum método de controle de custos, acabam tendo prejuízos e não sabendo controlar seus gastos com a produção, mão de obra, matéria prima e etc, com isso acabam por desconhecer informações importantes que poderiam servir de base para melhorar sua produção e seus lucros.
Assim, o produtor rural poderia tomar suas decisões baseadas nessas informações como, por exemplo: o que produzir e quando produzir, ou seja, qual a melhor época para se produzir tal cultura, saber se existem condições no mercado para absorver sua produção, estabelecer a maneira como ira produzir, que tecnologias utilizar, os recursos para diminuir os gastos e por fim avaliar os resultados obtidos com a produção.