Balanço envolve todas as contas Patrimoniais de Ativo e Passivo já o Balancete engloba todas as contas do Balanço mais as contas de Resultado: Receitas e Despesas.
Sendo assim para se fazer um Balanço primeiro se faz um Balancete, após, se apura o resultado confrontando todas as contas de Receitas e Despesas e o resultado é destinado as devidas Reservas e contas de Prejuízo ou Lucro Acumulado. Com isso, o valor do balanço será somente com contas de ativo e passivo, ja no balancete são todas as contas, por isso essas diferenças é normal, só iria bater se no seu balancete não tivesse lançamentos nas contas de resultados que é muito pouco provável.
Espero ter ajudado.
Grato;
Maciel Figueiredo