Boa noite Danieli.
Pelo que li sua pesquisa tende a um estudo de caso, já que você deseja aplicar um estudo em uma empresa.
A minha monografia também foi assim, no meu caso fiz um estudo sobre custos.
Tenha em mente a questão de que a chave para um TCC é o problema. Tendo um bom problema e traçando os objetivos gerais e específicos você tem um mapa, um caminho a seguir, e isso ajuda muito.
Quanto a ser algo limitado, não se preocupe com isso, na mono deve haver essa limitação, uma vez que você não pode falar de tudo e sim escolher algo específico e ir a fundo.
Eu não consegui ver um problema quando você escreve que faria a descrição dos procedimentos para operacionalizar uma empresa no lucro real.
Veja que para isso existem manuais, livros e etc, com o passo a passo, a não ser que depois de descrever os procedimentos você pudesse analisar se a empresa em questão está ou não utilizando os mesmos e quem sabe até demonstrar o impacto do não uso, se for o caso.
Geralmente o problema em um estudo de caso vem de alguma comparação, mas pelo que você escreveu não é isso que quer fazer, então pode ser que um estudo de caso não seja o indicado.
Já quanto as obrigações acessórias, não seria difícil encontrar um problema. Se você tivesse acesso a mais empresas, de um mesmo ramo, por exemplo comércio de material de construção, prestação de serviços médicos, etc. você poderia pesquisar quais na sua cidade se consideram preparadas para as novas obrigações, (SPED - Fiscal ICMS/IPI e PIS/Cofins, Sped Contábil, Sped Social e por ai vai). Se não tiver acesso a empresas, poderia tentar com escritórios de contabilidade.
Você também poderia pesquisar qual o custo que as empresas, do ramo escolhido, na sua cidade, ou região (veja as limitações)estão tendo, tiveram ou planejam ter para o cumprimento delas. Seja o custo com software, treinamento de pessoal, honorários contábeis etc.
Seu tempo disponível pode ajudar a determinar o tipo de pesquisa.
O estudo de caso por exemplo, você tem mais facilidade em obter os dados, pois se a empresa concorda em ser estudada ela lhe dará acesso aos dados, mas o tratamento desses dados é muito trabalhoso e isso leva muito tempo. Imagine que você teria que realmente fazer a contabilidade com base no lucro real de um período da empresa. E isso para ser correto e ter validade científica não pode ser feito de qualquer maneira.
Já em uma pesquisa que use ferramentas estatísticas tende a ser mais difícil a coleta dos dados, pois nem sempre as empresas ou escritorios de contabilidade tem disponibilidade de tempo, ou interesse em ajudar. Mas você pode delimitar um tempo para obter as respostas, passado o tempo você faz com o que tem.
Depois de ter os dados, que não precisa ser de todos os entrevistados desde que seja uma amostra considerável, é geralmente mais fácil de fazer o tratamento do que no estudo de caso.
Espero ter ajudado. Boa sorte e sucesso!