Boa tarde, Rafael
Esse processo é o de subcontratação.
A entrada por compra da MP será pelo CFOP, dependendo da finalidade da MP.
1101 - quando MP
1102 - quando revenda
2101 - quando fora do estado
3101 - quando importado
O fornecedor deverá emitir uma nota fiscal triangular uma de venda para o seu estabelecimento (essa alimenta o estoque MP) e a outra para o fornecedor que irá industrializar, quando entrar a NF de venda você deverá emitir outra NF conforme abaixo:
Para saída da MP será com uma NF CFOP 5901 que essa operação irá retirar o material do estoque "livre" para estoque em terceiros. (não sei qual o sistema vc possui).
no retorno o fornecedor deverá emitir uma NF CFOP 5902 que é o retorno da MP, para que possa baixar o valor alocado na conta poder em terceiros.
outra NF CFOP 5124 que retornará o valor do serviço, mas o material acabado ( que alimentará o estoque).
Para controle contábil você precisa entender se o sistema que você trabalho esta parametrizado para as operações acima.
Espero ter ajudado. Fernanda