Ronaldo,
Se a conta que você quer alterar teve movimentação em períodos anteriores até a data em que você pretende alterar a conta, você deve ter em mente as seguintes situações:
1 - A maioria dos sistemas não mantem o histórico de que essa conta foi alterada com a inteligência de separar o razão com os registros anteriores e posteriores a alteração da nomenclatura.
2 - Se a situação que citei acima, reflete em seu sistema, vai aumentar os cuidados e a memória de cálculo que você deve manter ao preencher declarações assessórias.
2 - O ideal é sempre fazer essas alterações ao fim do exercício, pois você gravará pelo menos em mente, a data da alteração da nomenclatura.
Mas respondendo sua pergunta, sim, você pode remanejar seu plano de contas.