Bom dia Anselmo.
O código fiscal 5949 e 6949 são códigos fiscais genéricos, ou seja, são usados para situações que não se enquadram em nenhum outro código da tabela. Por isso, você deverá analisar se haverá contabilização desse código pela Natureza da operação. Vou citar aqui alguns exemplos em que se contabiliza e outros que não se contabiliza:
5949/6949-Simples remessa: Não se contabiliza
5949/6949-devolução de compra: contabiliza
5949/6949- transposição de estoque para ativo imobilizado: contabiliza
5949-6949- transposição de estoque para uso/consumo: contabiliza
(...)
Outra forma de analisar quando contabilizar ou não é pela transferência de propriedade ou geração de custo/receita, pois nestes casos deverá contabilizar.
atenc.