livro caixa versos conta correte

olá pessoal faço a contabilidade de um sindicato de trabalhadores rurais,onde toda movimentação é lançado em um
livro caixa, e em um sistema contábil entradas e saídas porem o que sobra eles deposita em uma conta corrente e eu não lancei esses depósitos,e porque a ao meu ver se eu lançar vai dar duplicidade de caixa ,e todo o saldo deles é o da conta corrente
só que o livro diário deles não bate com o saldo que eles tem no banco mas o livro caixa com o sistema está igualzinho fiz os lançamento desta maneira .
D-recebimento de associado e e contribuição sindical
C-todas as despesas no perilo incluindo taxas bancarias tais como extrato,movimentação bancarias etc.
eles tem prestação de conta anual no dia 26/03 eu e o presidente estamos malucos pois no livro caixa e no balancete de verificação
tem um saldo de 40.000,00 e na conta corrente apenas 18.390,00
ta com um furo de 21.610,00
se alguém tiver uma solução para esse meu problema ficarei grata.