Boa noite Michel,
Bom, em primeiro lugar, o código de ética me impõe limitações em palpitar no trabalho de outro colega. Depois, me impõe estar a par de todas as informações antes de dar opinião sobre qualquer assunto... Mas vou tentar te ajudar sem interferir no trabalho do colega.
Mas a melhor orientação o seu contador já lhe deu: ir até a receita. É chegar lá e pedir informação, chorar umas mágoas e tal, que o pessoal da receita costuma ser bem atencioso. Conta uma história triste, que eles geralmente ajudam. São as melhores pessoas para informar o que está acontecendo.
Caso o problema não seja resolvido, converse com o seu contador sobre a possibilidade de tirar um certificado digital e ou acessar o e-cac para ver se consegue alguma informação mais específica, não sei se ele já tomou essa providência.
Se nenhum dos dois resolver meu amigo, aí realmente ir na procuradoria, como ele lhe indicou, talvez seja a última esperança.
Um forte abraço.