Luiz, os valores retidos na fonte tem que entrar na declaração de cada ano, portanto, o crédito de 2017, deve ser lançado na declaração de 2017 e recuperar via perdcomp, seja por pagamento a maior, caso sua empresa recolheu imposto, ou por saldo negativo de irpj, caso apresentou prejuízo fiscal na declaração anual.
Já o IR retido ref. 2018, pode ser aproveitado normalmente nas suas apurações, porém, como você mencionou, o IR trata-se de aplicação financeira e o mesmo só pode ser aproveitado nas apurações de estimativas caso levantado balancete de suspensão ou redução. No caso de estimativa por presunção (pelo que entendi foi esse o caso), não pode utilizar o IR retido já que o rendimento de aplicação financeira não compõe a base de cálculo do IRPJ, conforme § 7º, art. 222 do Decreto 9.580/18 e arts. 39, § 17. e 40, § 1º. da IN 1700/17, nesse caso só utilizará na apuração de ajuste anual em dezembro.