Custo Médio

Bom dia pessoal!

Gostaria de saber como é tratado o custo médio em empresa importadora?
Recebemos produtos em devolução de clientes e eles ficam no Armazém (SU), que posteriormente será eliminado como Sucata.
A minha dúvida é com relação ao custo médio deste armazém? Ele está muito maior do que o Operacional (Produtos para Revenda), com relação ao mesmo item.

No meu entendimento o custo médio, independente de armazém, deveria ser o mesmo, em todos. E não é o que acontece.
Agora preciso fazer uma baixa destes produtos para SUCATA, temos laudo, mas a minha dúvida é se o meu raciocínio está correto, posso fazer o ajuste do custo médio antes de fazer a baixa?

Obrigada
Heloísa