Problemas de utilização cfop para controle de estoque fiscal.

OLA, estou com um problema em relação a utilização do cfop, aqui e uma empresa de guincho e vendas de peças para veículos, utilizo o cfop 5403 para emitir notas de venda de peças, as notas que recebo de entrada de peças vem com o cfop 5405, porem quando compro peças que serão utilizadas nos veiculos da empresa vem com o mesmo cfop 5405, já questionei com o vendedor sobre isso pedindo para que fosse colocado um cfop de venda para uso, ele então me informou que não poderia alterar esse cfop que o que a contabilidade deles poderia fazer era emitir uma nota de retificação depois da NFE emitida, esta correto isso? e como que eu faço para dar saída nesses produtos para uso próprio? já que o cfop veio 5405.

DESDE JÁ GRATO.