Contabilização de serviço de transporte prestado por filial

Boa tarde.

Trabalho em uma empresa que pretende abrir uma filial para transportar os produtos produzidos pela matriz e por outra filial, essa filial a principio não tera frota suficiente para transportar todo o volume de vendas das outras duas unidades, sendo necessário subcontratar. Pelas nossas pesquisas, devido a subcontratação será necessário emitir os CTEs para acobertar a operação de transporte, minha dúvida é quanto a contabilização desses CTES, os valores serão contabilizados usando contas transitórias apenas?