Nota fiscal eletrônica

Bom dia, minha dúvida seria a seguinte, temos um cliente que precisa devolver uma mercadoria que veio para ele como contrato de comodato, só que após ele adquirir a mercadoria a empresa sofreu alteração, onde foi alterado CNAE, endereço, Razão Social, praticamente a única coisa que não alterou foi o CNPJ, como deveria prosseguir com essa devolução? seria somente emitir a nf de devolução? Afinal o CNPJ não alterou. Desde já agradeço.