Prezada Paula, boa tarde!
Apenas contextualizando....
Por ser uma Entidade Sem Fins, o primeiro passo é verificar se o Bem foi adquirido com algum tipo de Recurso Vinculado ou de Convênio. Neste caso, seria necessário avaliar o instrumento que deu origem a parceria para certificar-se que a baixa pode ser de forma simples ou se é prevista alguma compensação, responsabilização, reposição do item, etc...
Caso o Bem tenha sido adquirido com Recursos Próprios das atividades, a baixa não trará nenhum problema. Porém, recomendo que analise se o assunto não foi tratado também no Estatuto.
Aqui, utilizo o lançamento contábil que reflete a situação prevista/permitida no Procedimento do Ativo Imobilizado da Instituição:
D - PERDAS POR AVARIAS/FURTO OU ROUBO (RESULTADO)
D - ( - ) DEPRECIAÇÃO ACUMULADA (ATIVO) *
C - IMOBILIZADO (ATIVO)
(*) conforme informado por você, o item não possui depreciação, então, não haveria esta conta.