Serviços prestados com valores glosados

Boa tarde! Srs.
 Uma empresa prestadora de serviços seguimento área da saúde regime Lucro Presumido presta serviço para um hospital que sempre quando faz o pagamento dos serviços tem um valor glosado. Ex. NS R$ 5.000,00 valor glosado R$ 2.300,00 sendo que não tem como solicitar o cancelamento da nota de serviço devido o pagamento ser no mês posterior ao da emissão da nota. A minha duvida é, como faço reajuste desse lançamento no mês seguinte nas obrigações assessorias como DCTF e EFD- contribuições para a empresa não venha ficar no prejuízo de esta pagando tributo a mais do valor que devido.

Deste já agradeço.