Notas de comissão

Olá, bom dia a todos.
 
Senhores, espero que estejam bem?
 
Temos uma empresa que um franqueado do qual recebe uma somatóriaenviado pela franquia onde são valores destinados a pagamento das despesas e
comissão em deposito só.
Você poderia me ajudar a nota eu emito com valor da comissão,certo? Ou tenho que emitir valor cheio do deposito? Podem me orientar de que
forma proceder nessa situação?