Boa tarde, colega!
Como alguém que faz muitos, mas muitos, desses estudos, te digo que é mais fácil fazer no seu sistema contábil normal ou no bom e velho excel.
Eu costumo fazer da seguinte maneira, crio uma empresa nova no sistema, importo todas as configurações e lançamentos da empresa que já existe, e reapuro o ano anterior inteiro com o novo regime solicitado, para termos uma ideia de quanto a mudança implicaria nos parâmetros atuais, e depois sento com o cliente e converso sobre projeções de valores, e possíveis mudanças que poderiam ser feitas visando o novo regime, e assim projeto os próximos 12 meses seguintes, e quando daria.
É a maneira mais eficiente de fazer, porém se a empresa tem muitos produtos pode ser um pouco demorado configurar todos em função do PIS/COFINS, ai talvez seja mais eficiente só calcular genericamente, aplicando as alíquotas de PIS/COFINS, sobre todas os insumos ou mercadorias e sobre as saídas, ai apura o PIS/COFISN e ajusta a DRE com os novos montantes para recalcular o lucro fiscal e ter uma boa ideia do impacto tributario.
Abraços,