Boa noite Alexandre,
Como você vai pegar uma empresa que está em andamento, o contador anterior tem que lhe passar no mês fechado, ex: você pegou a partir de 02/2011, então o contador anterior tem que encerrar o balanço em 28.02.2011 e não em 10.02 ou 22.02.
A partir deste fechamento as contas de ativo e passivo tem que fechar, OK? ja apurado o resultado do período.
Quando você for lançar no seu sistema, lancar (apenas exemplo), como saldo em 28.02.2011, ou seja, saldo final de 02/2011 que é o correto, levando em consideração que você vai começar a partir de 03/2011.
Acho que seu sistema entende saldo inicial como 01/01/2011.
Espero ter ajudado.