Caro Diego,
Vamos por partes:
Vc inclui na folha um autônomo de R$ 725,00...então o recibo de pagamento ao contribuinte individual ficou com o valor líquido de R$ 645,25 (725 -11%)...
Quando vc envia para o SEFIP ele vai levar para o formulário "COMPROVANTE DE DECLARAÇÃO DAS CONTRIBUIÇÕES A RECOLHER À REVIDÊNCIA E A OUTRAS ENTIDADES E FUNDOS POR FPAS" (um dos que compõe aqueles vários que o SEFIP emite) lá no campo SEGURADO, no sub-ítem "Contribuintes Individuais", o valor de R$ 79,25 referente à retenção. dos 11%.
Se sua empresa for optante pelo SIMPLES é apenas este valor a ser pago que teria por base o pagamento efetuado ao autônomo.
Se sua empresa não for optante pelo SIMPLES, além do valor retido de 11% descrito acima, há também a obrigatoriedade de pagar mais 20% no campo EMPRESA, sub-ítem Contribuintes Individuais o valor de R$ 145,00. O valor total referente a este pagamento ao autônomo seria então de R$ 224,25...
Isto é o que devia estar aparecendo na sua SEFIP....
Se não estiver, tente inserir estas informações diretamente no SEFIP (sem importar dos sistemas de folha de pagamento) . Talvez resolva!
Ajudei? ou compliquei?