Vinicius, a média se calcula em separado, exemplo
Hora extra de Abril/2013 = 550,00
Salario = 1500,00
Então a média é de (550/1500)= 0,36 ou 36%
Deverá ser feito isso para cada mês (que consta h.extra e outros adicionais(noturno/insalubridade/periculosidade) comissões, ...))
Depois deverá dividir pelos meses a que se referir a verba,
Férias = média dentro do periodo aquisitivo a ser pago,
13 Salario = de Janeiro a data do pagamento
Aviso Prévio = dos últimos doze meses, ou convenção coletiva de trabalho.
A sua pergunta, foi sobre o décimo terceiro, então a média será sobre
(h.extra, comissões, insalubridade, periculosidade, ad.noturno, e outros se houver)
Exemplo
Janeiro/2014
Salario = 2.200,00
H.Extra = 540,00
Comissão = 320,00
Ad.Noturno = 55,00
A média será a soma (h.extra+comissão+Ad.noturno)/salario = 0,42 ou 42%
Isso você deverá fazer para os meses de Janeiro até o mês anterior ao pagamento, depois a média dos índices
Exemplo;
Janeiro/2014 = 33%
Fevereiro/2014 = 25%
Março/2014 = 15%
Abril/2014 = 10%
Maio/2014 = 0%
Junho/2014 = 5%
Total = 88%
Média será de (88/6)= 14,6%
Então multiplica-se o resultado pelo salario atual, ficando assim
Salario atual = 3.000,00
Média = 438,00 (3.000,00 * 14,6%)
Espero ter ajudado