sefip em duplicidade

passei a sefip de um funcionario com as verbas em duplicidade ,quais são as complicações que posso ter com o ocorrido, alguem mais experiente poderia me orientar , paguei inss e fgts em cima de bases duplicadas , no que poderia prejudicar ao funcionario ?
E como faço para resolver ?

Bom dia, Priscila
Prejudicar o funcionário não vai pode ficar tranquila quanto a isso. Gere novamente o sefip com os valores corretos, ai poderá na próxima guia de inss compensar os valores pagos a maior. Referente ao FGTS terá que pedir a restituição de valor.

Priscila Trindade , exatamente como o Ronan Eustaquio Candido explicou.

Uma SEFIP sobrepõe a outra, neste caso, gerar novamente o arquivo e transmita com as informações corretas.

Boa tarde!