FGTS de colaborador AFASTADO

Bom dia pessoal!
Gerei a SEFIP do 13º de uma funcionária que está a mais de um ano recorrendo da decisão do INSS.
Ela não está afastada por acidente de trabalho.
A empresa já pagou o FGTS e já consta no extrato.

Qual o problema legal que isso pode acarretar?

Ela em sistema esta afastada por auxilio doença uma vez que está entrando com recursos, não está trabalhando certo? só recolheria FGTS se fosse acidente de trabalho mas se por equivoco recolheu o FGTS não tem problema só corrija o sistema para não recolher mais (auxilio doença)