FGTS caindo somente em uma conta!! alguém já viu isso?

Boa tarde! Tem um funcionário (farmacêutico) que está com vínculo em uma Matriz e na Filial, os FGTS estão cadastrados todos os dados certo MATRIZ e FILIAL, só que quando vamos olhar o extrato ambos os pagamentos estão caindo somente na filial, o que devo fazer pra que os pagamentos caiam cada um tanto na matriz quanto na filial?

Joel, boa tarde.
Você já verificou as SEFIP's (matriz e filial)?
Pode ser que no caso de FGTS o sistema da folha esteja UNIFICANDO os PIS, então o sistema acaba somando os dois e enviando através de uma sefip (matriz ou filial).

Joel Costa passei por esse mesmo problema. Nem a Caixa sabe informar como proceder para regularizar a situação...

Já verifiquei sim Carlos Alberto, cada SEFIP está sendo enviada individualmente, quando entro no conectividade icp, com o certificado da matriz e coloco o pis do funcionário passa direto para o cnpj da filial.