Boa tarde, Fabiana. Nunca tive problema com RAIS, mas tentarei te ajudar.
Não entendi muito bem a sua dúvida: você entregou a retificadora de 2017, conseguiu o recibo, só que ele não saiu identificado como retificador e; não conseguiu imprimir ou consultar a declaração transmitida?
A GDRAIS genérica é feita pelo programa. O recibo é emitido no próprio programa, após a transmissão. A declaração também é impressa no programa da RAIS.
Então, ou a declaração não foi transmitida e você está pegando o recibo da original, ou há algum problema técnico no programa ou no site do MTE. Tente revisar todo o processo. Se necessário, desinstale e instale novamente o programa da RAIS, mas antes faça um backup dos arquivos.
Se nada disso solucionar o seu problema, vá até o Ministério do Trabalho, com procuração e os documentos da empresa. Lá , alguém irá te atender, e dizer se a retificadora foi processada ou não. Não sei se eles irão imprimir ou te fornecer, mas no sistema deles deve aparecer o processamento das declarações.