Boa tarde Tatiana!
A empresa deve refazer a sua rescisão com a modalidade correta (Termino de contrato de experiencia no prazo), uma rescisão complementar não irá mudar o status da rescisão inicial.
Caso a empresa não cumpra o pagamento da rescisão no prazo de 10 dias contados da data do desligamento assim como a entrega da documentação, terá que pagar a multa de um salário prevista no art. 477 da clt.
§ 6o A entrega ao empregado de documentos que comprovem a comunicação da extinção contratual aos órgãos competentes bem como o pagamento dos valores constantes do instrumento de rescisão ou recibo de quitação deverão ser efetuados até dez dias contados a partir do término do contrato. (Redação dada pela Lei nº 13.467, de 2017)
§ 8º - A inobservância do disposto no § 6º deste artigo sujeitará o infrator à multa de 160 BTN, por trabalhador, bem assim ao pagamento da multa a favor do empregado, em valor equivalente ao seu salário, devidamente corrigido pelo índice de variação do BTN, salvo quando, comprovadamente, o trabalhador der causa à mora. (Incluído pela Lei nº 7.855, de 24.10.1989)