Desconto de Atrasos em folha de pagamento

Bom dia
Há algum impedimento para desconto de atraso na folha de pagamento de funcionários quando a empresa adotou o banco de horas?
A funcionária avisou que vai chegar mais tarde porque não conseguiu dormir direito. Ela já está com saldo negativo.
Além da advertência posso descontar na folha ou somente acumular no banco de horas?

Boa noite!
Há de se observar que em direito, o banco de horas deve ser uma via de mão dupla. Afinal, quando a empresa requer determinado trabalho extraordinário, o empregado acumula para compensar posteriormente, e quando o empregado comunica que precisa chegar mais tarde, é descontado e advertido ? me parece uma sanção o tanto abusiva da empresa.
Antecipa-se também que não haveria necessidade do empregado está doente, pois estaríamos diante de falta justificada.

Larissa,

Se a funcionaria já esta com o banco de horas negativo, chame a mesma pra conversa explane a situação e veja como vai ser feito pra ser compensado se possível também veja o acordo coletivo da categoria na qual fala sobre o banco de horas.

Agora advertencia na funcionaria acredito que antes de ter essa primeira conversa não faz muito sentido.