Nona Hora

Gostaria de ajuda para o seguinte caso.
Colaborar trabalhar no terceiro turno e aí já começa a dúvida.
Sua jornada cadastrada está como 8:20 sendo de 22h as 06:20. Quando a hora noturna deveria ser considerada 52:30 por lei. Logo, sua jornada não deveria ser 8:20.
No holerite, vem a descrição nona hora 20%
Porque 20%? O colaborador está contestando o seu tempo de jornada e o pagamento desses hora nona 20% 
O mesmo alega que deveria contar no mínimo 1 hora extra por dia pelo fato de estender até as 06:20. Mas como sua jornada está cadastrada desta forma, o sistema não entende que ele faz 1 hora a mais. Pelo contrário, se ele não cumprir esse período,  os sistema entende como atraso.
Alguém pode ajudar?