FGTS EM ATRASO

Bom dia!
preciso recolher diferença de FGTS de 18 meses , mas é especifico para alguns empregados pontuais.
Pergunto, posso cadastrar somente o empregado em questão na sefip, informar os valores e recolher com os devido encargos?

Ou preciso regerar o sefip.re de totos os empregados, conferir todos os inss e fgts ja recolhidos, colocar eles na modalidade 9 , deixando apenas o empregado que tem recolhimento na modalidade 0 para geração da guia ?
Meu sistema não gera corretamente as informações dos anos anteriores, precisa conferir um a um e ajustar para fechar com os  valores ja recolhidos.

Bom dia!
Aqui tenho caso parecido e faço dessa segunda forma gero novamente a Sefip da competência e coloco na modalidade 9 deixando somente o funcionário que preciso fazer o recolhimento em atraso. A Sefip é totalmente manipulável então você pode fazer assim e fazer as correções de cada funcionário.