Funcionario de MEI sem envio de folha a anos, como Baixar registro ?

Boa tarde aos colegas,

Um contribuinte MEI registrou sua Mãe como CLT e ficou anos sem efetuar os pagamentos dos direitos trabalhista e agora me procurou para dar baixa na carteira. Existe algum modo de fazer a baixa sem gerar a cobrança de todas as pendencias ? Nunca foram enviadas as folhas de todos esses anos, somente a primeira..

Segundo MEI com situação assim que me aparece esse mês

Ótimo dia! 
Eu faria a rescisão dela zerada no mês seguinte a admissão dela. 
Gero pelo menos as DAE do mês de admissão e rescisão. Depois de lançado o desligamento, venho fechando o restante dos meses em aberto.