Prezado Odilon,
Você deve anotar a função gratificada na CTPS se ela for em caráter definitivo. Exemplo: Gerente que ganha R$ 1.000,00 + 600,00 pela função. na página do contrato você deve preencher R$ 1.000,00 + R$ 600,00 de função gratificada. Se ela for em percentual, preencha R$ 1.000,00 + 3,00 % de função gratificada. Com relação a anotações da evolução salarial na CTPS, você deve anotar conforme exemplo a cima. Exemplo: aumento de R$ 100,00 no salario e R$ 60,00 na função. anote na ctps em alteração salarial: R$ 1.100,00 + 660,00 função gratificada.
Se ela for em caráter transitório, você pode em anotações gerais fazer uma anotação que no periodo de XXXX a XXXX recebeu XXXX a titulo de função gratificada.