Isabela, doença relacionada ao trabalho equipara-se ao afastamento por acidente de trabalho, se for por NTEP (Nexo Técnico Epidemiológico Previdenciário). É a conversão que o médico perito faz na hora da perícia.
Nesse caso, é devido o recolhimento ao FGTS desde a data da conversão. As vezes tem que fazer recolhimento em atraso e a gfip será no código 660 só para esse trabalhador. Dá para contestar, se for o caso... mas para isso pesquise a IN INSS PRES 31 para ler sobre NTEP e tb o art. 337 do Decreto 3.048/99.
NO manual da GFIP vc encontra as informações a partir da página 125, para fazer essa GFIP.