Diony, se a marcaçaõ de ponto é em ficha individual ou em livro, a assinalação tem de ser em caneta. De forma alguma em lápis pois esse permite que se altere a anotação, e não pode haver alteração, rabiscos, rasuras, erros...
O apontamento tem de ser claro e preciso. Se um fiscal dá uma incerta na empresa poderá autuá-la aplicando 1 multa por cada erro encontrado, e muitas vezes a multa dobra de valor a cada reincidência (a cada erro encontrado).
Se o apontamento é mecânico, não é admitido nenhuma outra forma de anotação, escrever a mão sgnifica tentativa de fraude, e incorre a empresa na mesma política acima citada: autuação e multa por cada erro.
Sim, acho excelente a idéia de que haja uma política disciplinar para que os empregados colaborem na lisura dos apontamentos. Vc pode informar o que a Lei determina em termos de tolerância, e o que a empresa irá estipular. Vc pode até escalonar os tipos de erros e respectivas medidas disciplinares a serem adotadas. Faça uma circular que ficará em lugar visível à todos e, de preferência, entregue uma cópia a cada funcionário solicitando que cada um aponha seu "ciente" num relatório, de modo a não poderem alegar desconhecimento.
Boa sorte!!!