Tania, não recomnedo tais acordos, é necessário grande confiança para que isso dê certo, e já ví amigos que se tornaram patrão e empregado romperem por isso, o ex funcionásrio resolveu não devolver a multa.
Quanto as férias coletivas, seria necessário que vc explicasse melhor como estas se deram, pois a paralização é do interesse do empregador e quando o funcionário não conta ainda a quantidade de dias de férias iguais ao da paralização, o empregador é obrigado a pagar para ele ficar em casa, por meio da licença remuenrada. O mesmo se dá com emendas dos feriados. Se a empresa não tem permissão do sindicato (em Acordo ou em CCT), é concessão voluntária de folgas, os dias são abonados pelo empregador, sem poder requerê-los, compensá-los ou mesmo descontá-los.
Lembrando ainda que pela Lei, caso o empregado não tenha completado o período aquisitivo de férias na ocasião das férias coletivas, terá ele reiniciado o novo período aquisitivo de férias a contar do 1º dias das férias coletivas.
Como o empregador não dispõe de nada assinado pelo empregado, então, suponho que tudo foi irregular.
Sugiro que nada desconte e proceda aos cálculos como se ele não tivesse gozado de férias, cuidado pois com 2 anos de registro é possível que 1 das férias sejam pagas em dobro.
Com 2 anos o aviso prévio dele terá acréscimo de 3 dias por ano completado de contrato,i ncluindo o aviso prévio trabalhado (ou a projeção do aviso indenizado). Sendo o aviso trabalhado o prazo para pagamento das verbas é de ATÉ 1 dia útil após findo o aviso prévio. Verifique com seu Sindicato se eles impõe que os dias adicionais aos 30 dias do aviso devam ser indenizados, se for, o prazo do pagamento será após findo os 30 dias do aviso. Não esqueça que o empregado tem o direito em optar pela redução de 2hs/dia ou em 7 dias ao fim do aviso trabalhado.
Espero ter ajudado.