Não Richard, eu conclui meu processo sem problemas.
No momento que você pede a alteração de endereço, você também deve pedir a baixa da matriz, assim a receita analisa os dois casos simultaneamente, porque tecnicamente não tem como eu fazer esse processo por etapa, um de cada vez.
Vamos analisar: se eu fosse fazer esse processo em duas etapas, como seria?
porque eu entendo que não posso baixar matriz e deixar filial aberta, e no caso do segundo processo, não posso alterar endereço de uma da filial para onde já existe uma outra empresa.
então de qualquer forma a única solução é fazer esse processo em uma única etapa.
Me desculpem, me equivoquei no caso acima, achei que ele queria dar a baixa na matriz e alterar a filial, mas é mais simples ainda,e a resposta ainda continua sendo SIM, ele pode fazer isso em apenas um ato contratual, tanto na junta quanto nos outros órgãos.
o processo será analisado simultaneamente, então assim que eu der a baixa na filial, já altero o endereço da matriz.
Lembrando apenas que a 1° cláusula deve ser a de encerramento da filial, e consequente a de alteração da matriz.