Boa tarde, Aline !
Para transferir uma empresa de um estado para outro, você deve primeiro registrar a alteração na Junta Comercial de origem (MS). Em seguida, com o documento registrado, você deve dar entrada na Junta Comercial do Estado onde a empresa passará a funcionar (MT), o mesmo documento será registrado nas duas Juntas Comerciais, mediante os procedimentos normais do Cadastro Sincronizado da RFB.
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Lembrando ainda, se não for existir mais no estado de MS, tem que providenciar a baixa no estado e na prefeitura.
att..
Cianorte - PR - "Capital do Vestuário"
"O entendido sabe tudo, o sábio apenas o essencial"