Olá Renato,
Faça o seguinte, no site da Receita Federal acesse o portal do Simples Nacional, nesse portal faça a consulta pelo CNPJ da empresa se ela é optante pelo Simples e/ou SIMEI.
Caso for optante no mesmo portal tem a opção de você fazer a declaração sem movimento, no ato que você fazer a declaração e transmitir ela pra Receita vai dar a informação que como esta transmitindo fora do prazo vai gerar a multa, faça a transmisão e quando for imprimir o recibo de entrega já vai sair a notificação da multa, onde vai informar o valor, o periodo de apuração e o vencimento, o valor é de R$ 200,00 mais se for pago dentro do vencimento que informa na notificação tem redução de 50% passando para R$ 100,00 por declaração.
O pagamento é feito através de preenchimento de um DARF conforme a orientação da notificação.
Qualquer dúvida retorne.