Itamar,
Mas tem um porém, qual o embasamento legal que obrigue que todas as atividades que constam no contrato social estejam obrigatoriamente no CNPJ? ?? Simplesmente NÃO HÁ. Se por acaso você tivesse uma fiscalização e o fiscal quisesse multá-lo pro isso, ele não poderia porque não tem embasamento legal pra esse problema. Se ele achar ruim, é só dizer que está no Contrato Social, e isso é uma saída de defesa sua. Enfim, realmente é sugerível que atualize, mas que possa dar problemas para sua empresa por conta deste problema, como disse, não tem previsão em lei para isso.