Bom dia Caio!
Complementando nosso colega Paulo Henrique, você irá abrir uma Filial, sendo que o CNPJ da MAtriz (1ª Loja) é 00.000.000/0001-00 e o da Filial será 00.000.000/0002-00 e assim por diante.
Na alteração contratual que você deverá fazer e registrar na Junta Comercial, você poderá denominar o " Nome de Fantasia" da Filial, mas a razão social é a mesma.
Você não fala sua profissão, mas se não for contador, procure um profissional que ele irá fazer todos os trâmites para você. Caso você seja o Contador, as orientações acima irão te ajudar a fazer a criação da filial.
Sds
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