Caro Raniel,
Atualmente no DF é utilizado para abertura e encerramento de empresas o sistema RLE - Registro e Licenciamento de Empresas (clique aqui: https://rle.empresasimples.gov.br/rle/). Nesse sistema, deve-se criar um cadastro (clicando em "primeiro acesso" no canto superior direito do site) com o CPF de um dos sócios (em caso de sociedade empresarial ltda) ou do titular (em caso de EIRELI ou empresário individual). Após isso é só seguir as instruções e enviar a documentação para baixa.
Ressalta-se que com esse sistema a baixa se torna semi-presencial, ou seja, o distrato social será gerado e já enviado, mesmo assim, será necessária a entrega deste mesmo instrumento na Junta Comercial do Distrito Federal (instrumento em duas vias com assinatura e reconhecimento de firma por verdadeiro ou autenticidade). De qualquer forma, na capa do distrato social conterá orientações quanto aos documentos necessários. Ademais, deve-se incluir junto ao instrumento de encerramento, o DBE (extinção). Feito isso, finalize baixando a inscrição estadual.
Vale aduzir, ainda, que ao tentar criar o cadastro, será exigido o CEP cadastrado na RFB referente ao titular o qual se deseja criar o cadastro, portanto, o CEP deve ser o mesmo utilizado no momento em que se criou o CPF do respectivo titular. Caso não tenha essa informação em mãos, peça ao titular que se dirija à RFB e verifique ou atualize o CEP no Cadastro de Pessoas Físicas.