Boa tarde Wéderson!
Como não houve até o presente momento uma manifestação pertinente à sua dúvida, quero aqui deixar claro que é apenas um parecer, visto que cada estado tem suas particularidades.
Se a loja já está montada com o ativo fixo, mercadorias, etc... Seria interessante ter não só as notas fiscais de entradas das mercadorias para venda como também da compra do ativo, todas devidamente registradas no livro de entradas, se este for o caso. Questão de obrigatoriedade de livros ou outros ítens na empresa, desconheço. No meu ponto de vista acho que você não deve estar preocupado com mais nada, além de todos os documentos que comprove a veracidade dos fatos, ou seja, desde a parte de documentos de legalização da empresa perante os órgãos como também das instalações necessárias. Se a fiscalização exigir algo além disso, eles tem que primeiro orientar e não já autuar.
Ricardo