Eu não sei como funciona ai, mas aqui no interior de SP, eu faço o seguinte: solicito o arquivamento de alteração contratual da empresa no cartório, usando as seguintes cláusulas (ai vc adapta para o seu caso):
"CLÁUSULA PRIMEIRA
Coma adoção do Novo Código Civil, regulamentado pela Lei 10.406 de 10 de Janeiro de 2.002, empresa, supra mencionada, altera seu tipo jurídico,que antes era Sociedade Simples Limitada, passa a ter sua natureza jurídica como Sociedade Empresária,passando a ter seus atos arquivados no registro público de empresas a cargo da Junta Comercial;
CLÁUSULA SEGUNDA
A razão social que era XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX S/S LTDA. passa a ser XXXXXXXXXXXXXXXXXX LTDA;"
Depois faço a solicitação na Jucesp de abertura por transformação de tipo jurídico...