Boa tarde Thaís, tudo bem?
Pelo que eu entendi ocorre o seguinte:
Empresa B fornece material para a empresa A;
A empresa A repassa esses materiais para o MEI;
MEI retorna as confecções prontas para a Empresa A;
Empresa A retorna a confecção pronta para a empresa B.
Neste caso é uma prestação de serviço, a empresa A está terceirizando a confecção das peças, repassando o material necessário.
O MEI, prestador do serviço, está executando sua atividade-fim, haja vista que a sua contratação é realizar a confecção com materiais de terceiros e com o serviço concluído fecha-se o seu ciclo; Para a empresa A, por exemplo, o fato de MEI concluir o seu serviço não é atividade-fim e sim atividade-meio, haja vista que após receber a mercadoria pronta ela ainda tem trâmites a serem realizados.