Baixa retroativa em empresa Inapta

Estou com uma situação que a empresa, providenciou o distrato social em 2014, porém não providenciou a baixa na Receita Federal. Olhei o CNPJ que a empresa consta como Inapta, por omissão de declaração. Como a empresa está Inapta não consigo gerar o código de acesso pelo E-Cac, e pelo E-Cac de pessoa física a Receita Federal não aceita a solicitação do processo.  Alguma sugestão, de como proceder? Fazendo as declarações em atraso, e a tornando apta, mesmo estando baixada em 2014, terei as multas das declarações fora do prazo?  

O ideal seria entregar as declarações para reativar o CNPJ, e sim, terá multa por atraso na entrega dessas declarações.

Bom dia Lucas, como não tem como fazer o certificado do CNPJ o ideal é fazer aquela procuração via processo digital pelo ecac no certificado do escritório de vocês para conseguir fazer a entrega das declarações.