Nilson, vou te resumir por tópicos como é aqui no Pará, mas é bom que procures a junta comercial de sua cidade para comparar:
1- Deve dar entrada na junta comercial em 2 processos ao mesmo tempo: 1- empresário individual : em 4 vias, onde não deves alterar nada, fica do mesmo jeito da constituição ou ultima alteração. (paga taxa alteração)
2- Sociedade ltda: ver modelo (Sociedade ltda por transformação de empresário) onde não pode mudar, neste ato sócio empresário e acrescenta os demais. Atividades econômicas não pode mudar... (ver modelo do teu estado na junta comercial). (paga outra taxa alteração)
No próximo ato,poderá alterar o que quiser.
Depois altera CNPJ, segue alteração dbe, se tiver dúvida na alteração CNPJ, entra contato. Até a próxima.