Alteração de Dados Cadastrais - MEI

Boa Tarde!
Estou com dificuldades e gostaria, por gentileza, de obter um auxílio.
Uma empresa que foi constituída como MEI no exercício anterior, teve desenquadramento em 06/2012, portanto para a Receita Federal, a mesma é optante pelo Simples Nacional. Pois bem, decidiu agora realizar alterações de dados cadastrais (Nome, Cnae e Capital Social) , porém não vem sendo possível, pois a mesma não é mais realizada através do Cadastro Web e sim por meio do Portal do Empreendedor Individual, todavia ao dar início aos procedimentos, fui surpreendida com a seguinte mensagem: O CNPJ não é MEI .... Enfim, como proceder com a alteração, se pela Jucesp não é permitido e nem pelo Portal do MEI?
A empresa está deixando de ser MEI e tornando-se Empresário Individual e futuramente será transformada em Sociedade Ltda.
Obrigada.

Em São Paulo ainda não entraram no consenso sobre a alteração, a última informação que foi dada na JUCESP era que aguardassem.

Obrigada Phillipe!