Bom dia Melre muitas pessoas estão com o mesmo problema como você assim como eu estava ontem, estava tentando enviar com o e-cnpj estava dando esse mesmo erro quando liguei lá para Brasilia eles me informaram que o meu sistema xp estava dando muitos erros na pagina e o java 7 também estava atrapalhando muito.
Consegui enviar ontem por volta das 15:00 hs com o windows 8 e com o certificado e-cpf do contador.
Fique tentando que uma hora vai te aconselho enviar umas 12:00 ou no final do expediente pois o site deve estar sobrecarregado.