Olha só, pra vc colocar essa informação no seu arquivo da dirf, vc terá que abrir o arquivo no bloco de notas ou, de preferência, no notepad++.
Depois de aberto vc procura o identificador "DECPJ", depois vai no quarto campo (certamente é o campo logo após o nome da empresa), nesse campo vc informar algumas das opções abaixo:
0 - Pessoa jurídica de direito privado.
1 - Órgãos, autarquias e fundações da administração pública federal.
2 - Órgãos, autarquias e fundações da administração pública estadual, municipal ou do Distrito Federal.
3 – Empresa pública ou sociedade de economia mista federal.
4 - Empresa pública ou sociedade de economia mista estadual, municipal ou do Distrito Federal.
8 – Entidade com alteração de natureza jurídica (uso restrito).
Lembrando, que o campo de natureza do declarante só aceita número e apenas um caractere.
Espero ter ajudado.