Wesley bom dia...
Qual o tipo do seu certificado?
É A1 ou A3?
Outra coisa que pode dar problema é o seguinte:
Para o navegador achar o seu certificado confiável, você precisa ter toda a cadeia de certificados que emitiram o seu.
Estes são os certificados das Autoridades Certificadoras.
Tentei enviar aqui em anexo um repositório com vários certificados digitais dessas autoridades.
Se você for no Internet Explorer em: Opções da Internet/Conteúdo, lá vai ter um botão chamado Certificados.
Clicando neste botão você deverá achar o certificado que você instalou, ele deve estar na aba PESSOAL.
Observe ali se ele ainda está válido, por que se estiver vencido você não poderá usar.
Também ali você verá quem emitiu o seu certificado. Dê dois cliques nele. Se aparecer a mensagem que o certificado expirou é por que você deve renová-lo. Se ocorrer a mensagem que não foi possível verificar a autenticidade do arquivo é por que você deve instalar os certificados digitais da autoridade certificadora que o emitiu.
Se o meu anexo passou, descompacte ele e o abra com dois cliques, localize a autoridade certificadora na lista e mande instalar o certificado. Se você instalar algum outro por engano não ter nenhum problema por isto.
Você também pode tentar is no site da empresa que forneceu o certificado e procurar lá, geralmente na área de downloads. Ou me manda uma mensagem provada que eu lhe envio o repositório por e-mail.