Conhecimento de Transporte Eletrônico Complementar

Sou sócio de uma Transportadora no PR, estou com uma dúvida referente ao Conhecimento de Transporte Eletrônico de Complemento de Valores...
Foi realizado um frete e emiti o CTE normalmente, mas na descarga no cliente ouve atrasado e o caminhão ficou parado por varios dias. A Empresa embarcadora pediu para que eu gerasse um CTE com valores das diarias, entrei em contato com o Escrtitório Contábel, me informaram que deveria realizar um CTE de complemento de valores para não gerar imposto sobre as diarias.
Como deve preencher o CTE de complemento?
Coloco somente a diferença do valor ou o valor + a diferença?

Bom dia Rodolpho,

emiti com os mesmo dados do primeiro e no valor somente a diferença do novo valor acordado para o primeiro conhecimento emitido, já que é um complemento.

Atc

Bom dia, estou tenho uma empresa de posto de combustivel e temos caminhao proprio, registrado no cnpj da matriz.

Minha duvida e o seguinte
1 - Nao presciso emitir o conhecimento de frete pois o frete e proprio
2- a filial nao teria algum problema pois o cnpj muda, ou ele considera apenas a raiz do cnpj