Depósito Fechado

Olá,
Tem uma empresa Matriz que abriu uma filial de depósito fechado para armazenamento das mercadorias, e nesse caso é necessário o procedimento de emissão de Nota de remessa e retorno dessas mercadorias que vão para o depósito. Eu gostaria de saber se essas notas podem ser emitidas apenas pela matriz, fazendo uma remessa(saída) e o retorno como entrada? ou se é obrigatório que o depósito emitir as notas de devolução dessas mercadorias para a matriz?